Nel 1973 viene istituito il  Museo Diocesano d’Arte Sacra San Gregorio Barbarigo, con il compito della conservazione e valorizzazione culturale delle opere d’arte esistenti nella Diocesi di Padova e appartenenti a Enti o fondazioni religiose: si trattava di un primo embrione di museo, aperto al pubblico solo su richiesta.

L’attuale Museo Diocesano di Padova nasce nel 2000 grazie ai contributi stanziati dallo Stato in vista dell’anno giubilare, che hanno reso possibile il recupero di alcuni ambienti del Palazzo Vescovile e il loro riutilizzo come sede espositiva rendendoli accessibili al pubblico.

Si estende su una superficie di oltre 2000 metri quadrati, comprendenti il grande Salone dei Vescovi al piano nobile, le salette attigue sul lato est e l’ala meridionale, edificata al tempo del vescovo Francesco Pisani (1524-1567), già sede degli appartamenti vescovili. Il percorso museale comprende inoltre la sala San Gregorio Barbarigo al piano sottostante e il piano terra del palazzo, ex cantina voltata su pilastri oggi destinata alle esposizioni temporanee.

Il museo diocesano di Padova raccoglie preziose opere di pittura, scultura ed oreficeria, codici incunaboli, paramenti sacri provenienti dal Tesoro della Cattedrale e dalle parrocchie presenti nel territorio della Diocesi, a testimoniare il felice connubio tra espressione artistica, sapere artigianale e esperienza di fede. Percorso espositivo nelle sale procede secondo la trama cronologica dai secoli immediatamente anteriori al Mille fino ai giorni nostri.