L'archivio storico prodotto dalla Fondazione è fisicamente suddiviso in due grandi sezioni: 1. Amministrazione e Patrimonio 2. Fondazione, Biblioteca, Museo e Manifestazioni.
La Fondazione nasce nel 1869 per volontà di Giovanni Querini Stampalia che, in mancanza di eredi diretti, con il suo testamento lasciò in dono alla città di Venezia tutto il suo patrimonio per la creazione di un'istituzione culturale "atta a promuovere il culto dei buoni studi, e delle utili
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